张琦教授崇尚经典思维方法，倡导简单、通用、有效、价廉的方剂使用理念，强调“学以致用”，敢于用药治疗危重病 。其运用经方治疗疑难杂症，疗效如鼓中之叉，堪称经方临床运用的典范，是当代龙江医学院的一面旗帜 。
张琦教授在运用经方时，经常强调以下几点 。
抓住主症，不忘次症，对应好方好证 。张琦教授认为，主症是疾病临床表现中的主导症状，根据主症制定主方，每一方都有自己的主症 。只有掌握主症，不忘次症，才能从纷繁复杂的疾病中找到病机核心，给予相应的治疗 。
善用经方，灵活运用同类方剂，扩大经方应用范围 。张琦教授擅长在经方基础上加减变化，使之更符合病情，切中病机要害 。内、外医学、妇儿等所有常见病、疑难病均适用 。同时，“治病有定方，无定变病” 。应用仲景桂枝汤、麻黄汤、柴胡汤、栀子汤、承气汤、泻心汤、白虎汤、附子汤、陷胸汤等经验 。说明他所在的方子既有经方的骨头，又有自己机器的肉 。
善用组合公式 。张琦教授善用大复法治疗疑难杂症 。对于病机复杂者，常采用经方、时方、经验方、自创方组合使用，并注意各方针对不同病机的合理配伍，故每次均有停滞 。
【张琦运用经方的经验】疾病特效药 。张琦教授善用一些针对疾病和某些证候的靶向药物 。比如北方常用乌头治疗寒性关节痛，马钱子很好的用于神经性瘫痪，菟丝子常用于贫血，大剂量膏药常用于高热，虎杖常用于肝炎 。
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